Cozumel a souvent été décrite comme « El cielo en la tierra » (le ciel sur la terre). La nature a sans nul doute été généreuse avec cette île, en lui donnant forêts tropicales, mangroves et lagunes ; un écosystème de flore et faune tropicales et l'un des récifs les plus impressionnants au monde. Il n'est donc pas surprenant que ce soit une des destinations majeures des vacanciers qui viennent au Mexique. Les mangroves jouent un rôle important dans la conservation de cet écosystème. Celui-ci est de plus protégé par des parcs comme Chankanaab ou le Parc National Arrecifes de Cozumel. À Punta Sur, la lagune Colombia sert de refuge à la faune endémique de l'île, telle que les tortues et les crocodiles. Une tour d'observation rustique et agréable vous permettra d'y observer et photographier toutes ces espèces à distance. Un bon appareil photo muni d'un puissant téléobjectif seront donc là vos meilleurs alliés.

Les jardins botaniques du Parc Chankanaab possèdent une collection de centaines de plantes tropicales originaires de plus de vingt pays. C'est également un paradis pour la randonnée subaquatique, grâce à ses coraux et à ses formations de pierre calcaire. Ce parc vous propose aussi l'incomparable expérience de nager avec des dauphins, des lions marins (espèce d'otarie) et des lamantins.